Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hdac11Q91WA3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hdac11Q91WA3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hdac11Q91WA3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac11Q91WA3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.4 ms