Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hps3Q91VB4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hps3Q91VB4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hps3Q91VB4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Hps3Q91VB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hps3Q91VB4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms