Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TgdsQ8VDR7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TgdsQ8VDR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TgdsQ8VDR7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TgdsQ8VDR7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms