Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q8VDP2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8VDP2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q8VDP2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8VDP2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q8VDP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q8VDP2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q8VDP2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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