Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnaaf4Q8R368 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnaaf4Q8R368 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Dnaaf4Q8R368 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Dnaaf4Q8R368 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Dnaaf4Q8R368 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms