Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CipcQ8R0W1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CipcQ8R0W1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CipcQ8R0W1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CipcQ8R0W1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CipcQ8R0W1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms