Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casc3Q8K3W3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casc3Q8K3W3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casc3Q8K3W3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casc3Q8K3W3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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