Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1M4

Glis1, Zinc finger protein GLIS1, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis1Q8K1M4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Glis1Q8K1M4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Glis1Q8K1M4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Glis1Q8K1M4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Glis1Q8K1M4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Glis1Q8K1M4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms