Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX4

Rbm17, Splicing factor 45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm17Q8JZX4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rbm17Q8JZX4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rbm17Q8JZX4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rbm17Q8JZX4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rbm17Q8JZX4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rbm17Q8JZX4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Rbm17Q8JZX4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rbm17Q8JZX4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms