Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rasgef1bQ8JZL7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rasgef1bQ8JZL7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rasgef1bQ8JZL7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms