Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ep400Q8CHI8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ep400Q8CHI8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ep400Q8CHI8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ep400Q8CHI8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ep400Q8CHI8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ep400Q8CHI8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms