Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc28aQ8CEI3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc28aQ8CEI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc28aQ8CEI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms