Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc28bQ8CEG5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc28bQ8CEG5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc28bQ8CEG5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc28bQ8CEG5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms