Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt222Q8CCX5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt222Q8CCX5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt222Q8CCX5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt222Q8CCX5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms