Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Alx1Q8C8B0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Alx1Q8C8B0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Alx1Q8C8B0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Alx1Q8C8B0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Alx1Q8C8B0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms