Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ubqln3Q8C5U9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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Ubqln3Q8C5U9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Ubqln3Q8C5U9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ubqln3Q8C5U9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ubqln3Q8C5U9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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