Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SowahcQ8C0J6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SowahcQ8C0J6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SowahcQ8C0J6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SowahcQ8C0J6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SowahcQ8C0J6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms