Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Snx16Q8C080 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snx16Q8C080 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx16Q8C080 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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Snx16Q8C080 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx16Q8C080 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx16Q8C080 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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