Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Strip1Q8C079 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Strip1Q8C079 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Strip1Q8C079 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Strip1Q8C079 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Strip1Q8C079 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Strip1Q8C079 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms