Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXX9

Ccdc169, Coiled-coil domain-containing protein 169, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc169Q8BXX9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc169Q8BXX9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc169Q8BXX9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc169Q8BXX9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc169Q8BXX9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc169Q8BXX9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms