Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Catsper4Q8BVN3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Catsper4Q8BVN3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Catsper4Q8BVN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Catsper4Q8BVN3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms