Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUK6

Hook3, Protein Hook homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hook3Q8BUK6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Hook3Q8BUK6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hook3Q8BUK6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hook3Q8BUK6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hook3Q8BUK6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hook3Q8BUK6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.7 ms