Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcaf1Q8BNE1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcaf1Q8BNE1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tcaf1Q8BNE1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tcaf1Q8BNE1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tcaf1Q8BNE1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
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