Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prpf18Q8BM39 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Prpf18Q8BM39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prpf18Q8BM39 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prpf18Q8BM39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1520.5 ms