Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gtf3c2Q8BL74 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c2Q8BL74 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c2Q8BL74 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c2Q8BL74 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c2Q8BL74 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms