Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BGC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q8BGC1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BGC1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BGC1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BGC1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BGC1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q8BGC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BGC1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q8BGC1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q8BGC1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q8BGC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q8BGC1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q8BGC1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q8BGC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms