Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Srgap3Q812A2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Srgap3Q812A2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Srgap3Q812A2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Srgap3Q812A2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Srgap3Q812A2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms