Protein–RNA interactions for Protein: Q80YT9

Rbm11, Splicing regulator RBM11, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm11Q80YT9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rbm11Q80YT9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rbm11Q80YT9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rbm11Q80YT9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rbm11Q80YT9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms