Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrrc27Q80YS5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lrrc27Q80YS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrrc27Q80YS5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrrc27Q80YS5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms