Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nrde2Q80XC6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nrde2Q80XC6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nrde2Q80XC6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nrde2Q80XC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms