Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ttc29Q80VM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc29Q80VM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc29Q80VM3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ttc29Q80VM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1375.9 ms