Protein–RNA interactions for Protein: Q80TB8

Vat1l, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1lQ80TB8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vat1lQ80TB8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vat1lQ80TB8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vat1lQ80TB8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vat1lQ80TB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms