Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl29Q80T74 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Klhl29Q80T74 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Klhl29Q80T74 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Klhl29Q80T74 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms