Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sbno2Q7TNB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sbno2Q7TNB8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sbno2Q7TNB8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sbno2Q7TNB8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms