Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tmc8Q7TN58 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmc8Q7TN58 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmc8Q7TN58 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmc8Q7TN58 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmc8Q7TN58 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms