Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Rtl1Q7M732 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.23
Rtl1Q7M732 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
Rtl1Q7M732 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC41.38■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Rtl1Q7M732 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Rtl1Q7M732 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
Rtl1Q7M732 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC41.13■■■■■ 4.18
Rtl1Q7M732 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Rtl1Q7M732 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rtl1Q7M732 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Rtl1Q7M732 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rtl1Q7M732 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Rtl1Q7M732 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms