Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4bQ7M729 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Scn4bQ7M729 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Scn4bQ7M729 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Scn4bQ7M729 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Scn4bQ7M729 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms