Protein–RNA interactions for Protein: Q78TU8

Fam107a, Family with sequence similarity 107, member A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107aQ78TU8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fam107aQ78TU8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fam107aQ78TU8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fam107aQ78TU8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fam107aQ78TU8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.1 ms