Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rph3alQ768S4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rph3alQ768S4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rph3alQ768S4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rph3alQ768S4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms