Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Igsf3Q6ZQA6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Igsf3Q6ZQA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Igsf3Q6ZQA6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms