Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nudcd1Q6PIP5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nudcd1Q6PIP5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nudcd1Q6PIP5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms