Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NfrkbQ6PIJ4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfrkbQ6PIJ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NfrkbQ6PIJ4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfrkbQ6PIJ4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms