Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIC6

Atp1a3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a3Q6PIC6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atp1a3Q6PIC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atp1a3Q6PIC6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atp1a3Q6PIC6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atp1a3Q6PIC6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atp1a3Q6PIC6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms