Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gramd2bQ6PEM6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gramd2bQ6PEM6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gramd2bQ6PEM6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gramd2bQ6PEM6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms