Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dhx40Q6PE54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dhx40Q6PE54 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dhx40Q6PE54 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Dhx40Q6PE54 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dhx40Q6PE54 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms