Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc36Q6PDM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc36Q6PDM4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc36Q6PDM4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc36Q6PDM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.9 ms