Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q6PD19 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q6PD19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q6PD19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q6PD19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q6PD19 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6PD19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6PD19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6PD19 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q6PD19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6PD19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q6PD19 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6PD19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q6PD19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q6PD19 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q6PD19 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q6PD19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q6PD19 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q6PD19 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q6PD19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q6PD19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Q6PD19 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q6PD19 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q6PD19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Q6PD19 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q6PD19 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q6PD19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q6PD19 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q6PD19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q6PD19 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q6PD19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q6PD19 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q6PD19 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q6PD19 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q6PD19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q6PD19 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q6PD19 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q6PD19 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Q6PD19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q6PD19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q6PD19 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q6PD19 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q6PD19 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q6PD19 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q6PD19 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q6PD19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q6PD19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q6PD19 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Q6PD19 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q6PD19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q6PD19 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q6PD19 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q6PD19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q6PD19 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q6PD19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q6PD19 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q6PD19 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q6PD19 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q6PD19 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q6PD19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q6PD19 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q6PD19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q6PD19 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q6PD19 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q6PD19 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q6PD19 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q6PD19 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q6PD19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q6PD19 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q6PD19 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6PD19 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6PD19 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6PD19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6PD19 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6PD19 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q6PD19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q6PD19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q6PD19 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6PD19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6PD19 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6PD19 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6PD19 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6PD19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6PD19 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6PD19 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6PD19 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6PD19 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6PD19 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6PD19 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6PD19 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms