Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc189Q6NZQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc189Q6NZQ0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc189Q6NZQ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms