Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Colgalt2Q6NVG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Colgalt2Q6NVG7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Colgalt2Q6NVG7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Colgalt2Q6NVG7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt2Q6NVG7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms