Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SphkapQ6NSW3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SphkapQ6NSW3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SphkapQ6NSW3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SphkapQ6NSW3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SphkapQ6NSW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SphkapQ6NSW3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms